台南市政府針對「反台南鐵路東移自救會」訴求說明如下：
◎台南市鐵路地下化計畫與苗栗大埔農地徵收完全不同：
1.大埔案所徵收的土地，將劃設為廠商設廠用地、住宅區與商業區利用；台南鐵路地下化沿線協議價購或徵收的土地，其用途為重大交通建設，絕無所謂徵地開發、圖利財團情事。未來現有鐵路用地騰空後土地，在都市計畫核定本中已清楚標有為市區之主要公園道。
2.大埔案中，苗栗縣府僅辦理徵收補償；而台南鐵路地下化，市府會要求交通部儘量與居民協議價購，另台南市政府將提供額外的專案照顧住宅方案，於台南市東區興建一處照顧住宅，供地下化工程拆遷的合法住戶以優惠條件選購，以解決拆遷戶居住的問題。
3.大埔案徵收的目地為提供廠商設廠用地、及劃設商業區與住宅區，設廠地點的擇定有其他選項，其必要性有極大爭議；而台南鐵路地下化價購或徵收的土地並無其他選項，而鐵路地下化工程的必要性地方亦無反對意見(包括自救會亦不表反對)。
◎台南市政府延續行政院核定鐵路地下化版本說明如下：
一、台南市鐵路地下化計畫核定本迄今未曾修改
台南市鐵路地下化重大交通建設計畫從民國82年開始規劃，其間路線、工法雖曾有各種討論與評估，但行政院唯一核定的版本是在98年9月，內容是「在現行軌道東側以『明挖覆蓋工法』建設永久軌」，核定本確定迄今並未曾修改過，所以絕無所謂「東移」情事。
二、鐵路地下化是中央(交通部)在台南近20年來挹注的最重大建設
本計畫將全長8.23公里之既有鐵路全面地下化，取消9個平交道、8個地下道(5個車行、3個人行)及3處陸橋，完工後將有助於都市土地的縫合，總工程經費293億餘元，預計民國106年完工，是市民20幾年來引頸期盼的重大建設，對台南市的整體發展將扮演關鍵的角色。
三、台南市政府與居民溝通過程
1.101年8月28日、31日，台南市政府都發局與沿線居民進行4場次都市計畫公開展覽說明會。
2.101年10月26日自救會成員在台南市政府向賴市長陳情，主要訴求為「工法變更」。要求以「潛盾工法」，取代「明挖覆蓋法」。因屬工程技術領域，賴市長承諾邀台南市轄區內大學相關科系的學者專家，共同檢視行政院核定版本工法是否妥適？
3.102年2月6日市府在成功大學召開「工程技術論壇」，自救會指派代表並舉薦專家出席，全程在公共頻道全程轉播。自救會放棄「潛盾工法」，改提「徵用土地興建臨時軌」方案。
4.102年2月28日市府應自救會代表的要求，在不邀請交通部參加的前提下，由賴市長率市府相關首長，與自救會專家學者進行 3 個小時的討論。
5.102年3月18日在市政府簡報室向本市仁德區、東區及北區相關里長、社區發展協會理事長簡報市府的評估意見。
6.台南市都市計畫審議委員會專案小組，於102 年5月1日、2日請居民列席會議表達意見，共聽取數十組陳情人意見。
7.「專案照顧住宅方案」102年8月規劃底定後，賴市長將親自帶領市府團隊至各區里舉行說明會，向拆遷戶報告。
四、台南市認應維持行政院版本的理由
台南市政府經過評估「行政院核定本」與「自救會徵用土地興建臨時軌」二版本，分別從工法安全性、交通衝擊與都市發展三個層面反覆研析，發現自救會的版本並未優於行政院版本，故由賴市長在102年3月12日，在市議會第一屆第五會期施政報告時，正式提出市府決策，繼續推動行政院版本，並提出史無前例的「鐵路地下化拆遷戶專案照顧住宅方案」。
自救會方案與行政院版相同，都要拆除房屋，且其拆遷面積不會小於行政院核定範圍。 行政院版本直接在現有鐵路東側施作永久軌，只需切換1次鐵道系統。自救會方案必須切換3次鐵道系統，增加施工難度與鐵路營運風險。
自救會方案規劃於上方通行火車時，下方同步開挖施工，對於每天140餘班的火車通行安全有嚴重的影響。
自救會方案須增加 3 個平交道，相對於目前已有 9 個平交道絕對會造成重大衝擊。
自救會方案於完工後，鐵路地下化上方騰空廊帶寬度16.3公尺，居民取回的土地利用受限於現行建築法規，且沿線遍布通風口、逃生梯、抽水機房等必要設施，縱使可以重建，其範圍非原來面積，居住品質也無法提升。
五、台南市政府針對拆遷戶提出「專案照顧住宅方案」照顧被拆遷戶居住的權益
鐵路地下化是中央政府的重大交通建設，需地機關為交通部鐵工局，故攸關土地價購、徵收與拆遷房屋的補償都是由其主政，台南市政府必須配合做都市計畫的調整，但基於對市民的照顧市府責無旁貸，且自救會方案也同樣要拆屋，所以賴市長提出一個在台灣公共建設史上從無的「住宅照顧方案」，讓拆遷戶可一個更好的居住環境與空間。
照顧住宅方案的基地位於台南市生產路南側，鄰近未來鐵路地下化完工後新設的南台南車站、台南航空站與小巨蛋預定地，交通便利，區位良好。初步建築規劃將興建12-15層樓的大樓，包含店面與住宅，共計約365戶，以成本價提供拆遷戶申購，照顧拆遷戶確保其居住權益，並延續其社區感情。
有關鐵路地下化徵收土地並未違背土地正義原則：
1.政府機關每年開闢道路、興建公共設施、治山防洪建設，都會徵收民地，所以徵收制度乃民主國家的正當法律程序，並未違背土地正義原則。
2.台南鐵路地下化需取得民地係基於建設所需，並非要將土地變賣或開發，所以符合正當性與必要性。依目前工法拆遷房屋最少、需要民地最少，均應符合比例原則。
回應
Re: 反鐵路東移自救會北上陳情 市府
台灣立報 2014-1-20
反鐵路東移自救 戳破提案謊言
【記者劉仲書台北報導】反台南鐵路東移自救會20日召開記者會，針對16日民進黨總召柯建銘擅自宣稱「台南鐵路地下化經監委調查、南市府逐一拜訪居民、無民眾反對」，提案與國民黨黨團協商通過仁德段預算案一事，表達強烈不滿。自救會認為此案爭議繁多，民眾反抗不斷，柯的提案理由與事實不符。
自救會執行長陳致曉指出，監察院調查只看行政部門的片面說詞來證明台南市政府無違法，完全失格，台南市政府也因民眾強烈反對，未能完成沿線居民拜訪的工作。此次預算案路段的仁德區居民一直持反對意見，甚至北上懇求民進黨黨團調查清楚，但民進黨中央無視民眾請求，不接觸不溝通，顯見民進黨只顧自家人利益，根本不顧公義。
仁德區拆遷戶謝先生說，自己的房子當初買了之後還改修，花了上百萬，現在政府說只賠兩百萬，外面房價動輒上千萬，根本沒辦法再買房子。謝先生完全沒同意政府徵收，當初賴清德說會再去拜訪，結果根本沒來，他的太太因為不服氣而中風，自己只是臨時工，未來如何生存？他不是反對公共建設，只要賠償讓他們有飯吃就好。
同為拆遷戶的鄭先生也指出，大家都知道鐵路地下化對台南市有利，但市價補償是讓拆遷戶為公共利益犧牲，很多老居民都只有一間房子而已，徵收後難道要去睡馬路、睡鐵軌，再強制徵收，他們只好當釘子戶甚至搬去鐵軌住了。
學者：公聽、陳情全辦假的
政大地政系教授徐世榮說：「我已經下去台南很多趟了，工程技術論壇我提了一大堆問題，到都委會的陳情會我也提了一大堆問題，但台南市政府完全沒回答，公聽會、說明會、陳情會，全都辦假的！」徐世榮強調，根據最高行政法院判決，土地徵收一定要符合法律規定、有公益性、有必要性、符合比例原則，必須是最後迫不得已的手段才行，才會進入到補償，台南市政府從法律規定直接進入補償。徐世榮說：「大埔的區段徵收還可以領到地，鐵路東移的一般徵收只能領錢走人！比大埔更慘！」
一同聲援的灣寶愛鄉自救會的洪箱說，地方發展不需要犧牲這些人，劉政鴻亂搞結果他沒罪，這些政府判斷錯誤，犧牲人民生命財產，應該抓去關才對，人民對政府太寬容，卻對自己太苛薄。「我不是說你們政府都不對，我覺得政府都很有智慧，只是你們中央應該要反省，為什麼這麼多徵收案有人去自殺？因為政府說要，他們束手無策。」
綠黨王鐘銘指出：「民進黨跟台南市政府宣稱沒有居民反對，這個問題我們在各地都不斷看到，像淡海也是，營建署調查有七成居民支持，可是到地方一走，真正支持的人並不到一成，為什麼他敢說謊？因為他們有管道宣傳、去立法院提案、告訴媒體這些謊言，去欺騙社會大眾以為反對的人只有少數、是少數人在鬧事。」
反台南鐵路東移自救會主張，本案應採取徵用取代徵收，讓居民可以在工程後原地重建家園，民進黨也應調查本案的土地徵收是否具備「合法性」、「不可取代性」、「公益性」、「適當性」、「合乎比例原則」，並督請賴清德舉辦聽證會，妥善解決案件爭議，民進黨也應表態反對浮濫的土地徵收政策，透過立法系統立即修法停止悲劇。
市府：未因徵收得利
台南市政府20日下午回應，會在照顧市民權益、減少拆遷戶衝擊之前提下，秉持依法行政，市府也自102年10月中旬開始，透過逐一家戶拜訪，告知補償措施及權益的保障極大化，推動專案照顧住宅方案解決住戶居住權益的問題。而徵收土地及原鐵軌騰空土地皆作為鐵路地下化及道路用地，未作為開發之用，絕無刻意保留公有土地卻徵用民地的情形，市府並未藉徵收取得任何土地利益。對於部分人士一再提出此類不實指控，市府表示遺憾。
Re: 反鐵路東移自救會北上陳情 市府
戳破賴清德對06/22新聞追追追節目辯駁之謊言
反台南鐵路東移自救會
一、 06/22之節目揭露的「台南市政府為土地開發及第二階段區段徵收，要求台南鐵路東移！鐵工局表示願套圖看看！」已證實鐵路東移並非像賴清德長期放送的「鐵路東移政策是中央主導，南市府只是配合徵地」、「為了工程問題，所以才必需將鐵路東移」這兩大謊言，並戳破賴清德在媒體營造的「賴沒說謊，只是與民溝通不良」的虛偽面紗。南市府對此公文書明證並無力說明。
二、 本案土地徵收是否侵害基本民權的癥結在於「本案土地徵收是否有其必要性」，而非在於「騰空土地使用名目、是否安置居民、補償金額多少」等政客隨意亂扯的旁支細節。因為「台南市政府為土地開發及第二階段區段徵收，要求台南鐵路東移！鐵工局表示願套圖看看！」的公文書已證實「本案土地徵收是否有其必要性」完全不具必要性，所以賴清德傷害市民、違法濫權行徑甚明。
三、 「98年行政院核定計畫」明訂本案土地開發將根據「臺南市都市縫合計畫—鐵路地下化」施行。南市府謊稱「臺南市都市縫合計畫—鐵路地下化」僅是規劃研究參考，實屬謊言。
四、 「98年行政院核定計畫」明白估算本案土地開發利益。其中包含騰空土地開發利益甚明，不容市府單方憑藉今年四月才提出「新的都市計畫案」表示騰空土地將為公園綠地來混淆視聽。
五、 南市府今年四月才提出「新的都市計畫案」表示，將騰空土地將為公園綠地的最主要原因是要「疏解火車站前壅塞的南北向交通」。但此都市計畫書搶奪民眾土地開闢的近40m公園道，北側在南二中前終結、南側在民族路形成死巷，並無「疏解火車站前壅塞的南北向交通」的達成。此草率荒謬的都市計畫僅是南市府用來試圖漂白的工具。
六、 新店美和市200億弊案的土地徵收在開始時即以「公共交通建設」為名，再經都市計畫變更為「公園綠地」，又經都市計畫變更為「建地」並賤賣給財團。都市計畫為地方政客操弄，並不足證明該土地徵收的真正意圖。唯一能合理檢驗的，即在於土地徵收的「必要性」。但此「土地徵收必要性」卻一直被台南市政府避之不談。
七、 台灣監察院的趨炎附勢多有明例。民進黨對監委「只敢打蒼蠅、不敢惹老虎」也多有批評。一般民眾相對於政黨或政客，為弱勢。賴清德卻拿著一份邏輯不通、採單方說法的監委報告來護航，既無法，也無理來依據。
八、 「台南鐵路地下化的第二階段」在賴清德執政後也已舉行多次會議。南市府若要澄清無大規模區段徵收情事，何妨公布「台南鐵路地下化第二階段開發計畫」？為何堅拒提供資料給民眾？
06/22新聞追追追 https://www.youtube.com/watch?v=DbKna7wOLqY
06/24南市府辯駁文 http://underground.tainan.gov.tw/#prettyPhoto/5/